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Bioedit(分子生物學應用軟件)是一個功能齊全的免費分子生物學應用軟件,可以完成核苷酸序列和蛋白質(zhì)序列進行所有常規(guī)的分析操作,如:序列比對、序列檢索、引物設計、系統(tǒng)發(fā)育分析等。與 DNAMAN 相比,其分析內(nèi)容相對更豐富一些,而且提供了很多網(wǎng)絡程序的分析界面和接口。
可以完全核苷酸序列和蛋白質(zhì)序列進行所有常規(guī)的分析操作
序列比對、序列檢索、引物設計、系統(tǒng)發(fā)育分析等
與 DNAMAN 相比
其分析內(nèi)容相對更豐富一些
怎么利用bioedit做序列的比較
利用bioedit做序列比較
而且提供了很多網(wǎng)絡程序的分析界面和接口
首先要把所有的序列復制到windows自帶的記事本中,全部以fasta格式存到同一個文件中,保存成*.txt,序列內(nèi)部最好不要有空格或者換行。
序列格式舉例如下:
“>序列1 ATCG..........ATCG
>序列2 ATCG..........ATCG
>序列3 ATCG..........ATCG
>序列4 ATCG..........ATCG”
然后用Bioedit打開剛才保存的文件*.txt,點擊窗口上方的Accessory application菜單,再點擊clustelW multiple alignment,這時候會彈出一個窗口,直接選擇Run clustalW,又彈出一個窗口,選擇ok,等待結(jié)果就行了。
最后的比對結(jié)果可以保存成*.fas格式,適用于各種分析。
先行安裝原英文版軟件,再安裝本簡體中文包后運行主程序即可!
本簡體中文語言包是在7.0.1基礎上漢化的,同時也可以使用于各個版本的BioEdit。因采用語言包形式,故軟件中仍有不少地方顯示為英文。
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