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UGENE(綜合生物信息學(xué)工具軟件)是一個(gè)多平臺(tái)開(kāi)源軟件,主要目的是協(xié)助缺乏生物信息學(xué)經(jīng)驗(yàn)的分子生物學(xué)家管理、分析和可視化他們的數(shù)據(jù)。UGENE在一個(gè)常見(jiàn)用戶界面中整合了廣泛使用的生物信息學(xué)工具。該工具包支持多種生物學(xué)數(shù)據(jù)格式,并允許從遠(yuǎn)程數(shù)據(jù)來(lái)源檢索數(shù)據(jù)。
它提供了生物學(xué)對(duì)象(例如帶注釋的基因組序列、下一代測(cè)序(Next Generation Sequencing,NGS)裝配數(shù)據(jù),多重序列比對(duì),系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)和三維結(jié)構(gòu))的可視化模塊。大部分整合的算法被調(diào)整以通過(guò)使用多線程和專用處理器指令發(fā)揮最大性能。UGENE包括一個(gè)可視化環(huán)境以創(chuàng)建能夠在本地資源或在一個(gè)高性能計(jì)算(High Performance Computing,HPC)環(huán)境中啟動(dòng)的可重用流程。UGENE使用Qt框架以C++編寫(xiě)。內(nèi)置的插件系統(tǒng)和結(jié)構(gòu)化UGENE API使得可以用新的功能擴(kuò)展該工具包。
unipro是一個(gè)多平臺(tái)開(kāi)源軟件,其主要目標(biāo)是幫助分子生物學(xué)家在生物信息學(xué)中沒(méi)有太多的專業(yè)知識(shí)來(lái)管理、分析和可視化他們的數(shù)據(jù)。ugene集成了廣泛使用的生物信息學(xué)工具在一個(gè)通用的用戶界面中。該工具包支持多種生物數(shù)據(jù)格式,允許從遠(yuǎn)程數(shù)據(jù)源檢索數(shù)據(jù)。它提供了生物對(duì)象的可視化模塊,如注釋的基因組序列、新一代測(cè)序匯編數(shù)據(jù)。
生物(英語(yǔ):Organism,又稱生命體、有機(jī)體)是具有動(dòng)能的生命體,也是一個(gè)物體的集合,而個(gè)體生物指的是生物體,與非生物相對(duì)。其元素包括:在自然條件下,通過(guò)化學(xué)反應(yīng)生成的具有生存能力和繁殖能力的有生命的物體以及由它(或它們)通過(guò)繁殖產(chǎn)生的有生命的后代,能對(duì)外界的刺激做出相應(yīng)反應(yīng),能與外界的環(huán)境相互依賴、相互促進(jìn)。并且,生物能夠呼吸,能夠排出體內(nèi)無(wú)用的物質(zhì),具有遺傳與變異的特性。