GPAT生物序列模式搜索程序是時下互聯(lián)網常用的教育教學軟件之一，該軟件綠色、安全、無毒，讓你可以放心使用。KKv紅軟基地

軟件功能

GPAT生物序列模式搜索程序，開發(fā)的基于IBM Splash算法的生物序列模式搜索程序。運行環(huán)境為LINUX，多線程運行，使用多CPU，運行速度快，特別適合序列中重復模式的定位。KKv紅軟基地

軟件特色

目的獲取IBMSPLASH算法核心代碼，為進一步開展生物序列模式識別研究提供一個高效算法引擎。方法基于SPLASH算法開發(fā)核心代碼，運用開源軟件工具，開發(fā)、調試和優(yōu)化程序。結果開發(fā)出GNUPattern(Gpat)程序，高效實現了SPLASH算法的核心部分，并提供全部源碼，其他研究人員可以在GNU許可協(xié)議下修改該程序。結論Gpat成功地實現了SPLASH算法，并為下游生物序列模式識別研究提供鋪墊。KKv紅軟基地

相關介紹

生物序列數據挖掘的主要目的是識別序列中的功能元素、研究序列間的相互關系等等。生物序列模式挖掘和生物序列聚類是生物序列數據挖掘中重要的兩個研究內容。生物序列模式挖掘是識別功能元素進而了解序列功能等的關鍵技術， 序列模式還能夠描述序列特征，作為生物序列聚類相似性度量設計的依據;生物序列模式挖掘也是生物序列關聯(lián)分析的基礎。生物序列聚類是研究序列間相互關系進而解釋進化關系等的主要手段，其結果是具有共同特征的序列簇;另外在這樣的簇中挖掘序列模式能進一步提高序列模式挖掘結果的準確率，從而更好的指導功能元素的識別;生物序列聚類也可作為分類、異常挖掘等的預處理步驟。KKv紅軟基地

軟件截圖

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