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STORM(蛋白質分析軟件),風暴(系統(tǒng)定制的羊痘瘡數(shù)據(jù)檢索與管理)將blast、fasta、包含了和protparam的蛋白質分析結合在一個蛋白質序列的批處理文件中。它隨后以access數(shù)據(jù)庫格式總結和組織輸出。
更具體地說,風暴提取了orf預測后的蛋白質序列,然后對每一個蛋白質進行自動分析。該分析包括基于web的相似性搜索(blastp和fasta )以及包含了預測和蛋白質物理化學性質的protparam計算。然后對這些分析的原始產(chǎn)量進行分析和總結。所有這些步驟都需要最少的用戶交互(只需點擊幾下鼠標!)!)和所有數(shù)據(jù)存儲在Microsoft access數(shù)據(jù)庫中,允許對原始輸出以及此程序匯總信息進行控制(然而,創(chuàng)建摘要并不嚴格要求訪問數(shù)據(jù)庫)。該程序廣泛適用于任何一組蛋白質,但初步開發(fā)主要是為了分析噬菌體基因組。
蛋白質是生命的物質基礎,沒有蛋白質就沒有生命。因此,它是與生命及與各種形式的生命活動緊密聯(lián)系在一起的物質。機體中的每一個細胞和所有重要組成部分都有蛋白質參與。蛋白質占人體重量的16%~20%,即一個60kg重的成年人其體內(nèi)約有蛋白質9.6~12kg。人體內(nèi)蛋白質的種類很多,性質、功能各異,但都是由20多種氨基酸按不同比例組合而成的,并在體內(nèi)不斷進行代謝與更新。