VIZARD(分析和顯示Affymetrix基因芯片數(shù)據(jù))
- 軟件類(lèi)型：
- 國(guó)產(chǎn)軟件
- 軟件語(yǔ)言：
- 簡(jiǎn)體中文
- 軟件大小：
- 5 MB
- 軟件授權(quán)：
- 免費(fèi)軟件
- 軟件評(píng)級(jí)：
- 4
- 更新時(shí)間：
- 2017-05-16
- 應(yīng)用平臺(tái)：
- WinXP, Win7, WinAll
VIZARD(分析和顯示Affymetrix基因芯片數(shù)據(jù))是一款教育教學(xué)軟件！VIZARD(分析和顯示Affymetrix基因芯片數(shù)據(jù))，基因芯片技術(shù)的特點(diǎn)是使用寡聚核苷酸探針檢測(cè)基因。前一節(jié)使用ReadAffy函數(shù)讀取CEL文件獲得的數(shù)據(jù)是探針?biāo)降模╬robe level），即雜交信號(hào)，而芯片數(shù)據(jù)預(yù)處理的目的是將雜交信號(hào)轉(zhuǎn)成表達(dá)數(shù)據(jù)（即表達(dá)水平數(shù)據(jù)，expression level data）。存儲(chǔ)探針?biāo)綌?shù)據(jù)的是AffyBatch類(lèi)對(duì)象，而表達(dá)水平數(shù)據(jù)為ExpressionSet類(lèi)對(duì)象。
軟件功能
TAIR，NASCarray 和 EBI 都有一些公開(kāi)的免費(fèi)芯片數(shù)據(jù)可以下載。本專(zhuān)題使用的數(shù)據(jù)（Exp350）來(lái)自NASCarray，也可以用FTP直接下載。下載其中的CEL文件即可（.CEL.gz），下載后解壓縮到同一文件夾內(nèi)。該實(shí)驗(yàn)有1個(gè)對(duì)照和3個(gè)處理，各有2個(gè)重復(fù)，共8張芯片（8個(gè)CEL文件）。
為什么要進(jìn)行芯片質(zhì)量分析？不是每個(gè)人做了實(shí)驗(yàn)都會(huì)得到高質(zhì)量的數(shù)據(jù)，花了錢(qián)不一定就有回報(bào)，這道理大家都懂。
芯片實(shí)驗(yàn)有可能失敗，失敗的原因可能是技術(shù)上的（包括片子本身的質(zhì)量），也可能是實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)方面的。芯片質(zhì)量分析主要檢測(cè)前者。
軟件特點(diǎn)
體積小，但功能強(qiáng)大。界面非常清爽，簡(jiǎn)單易操作。
相關(guān)介紹
基因（遺傳因子、遺傳基因）指攜帶有遺傳信息的DNA序列，是控制性狀的基本遺傳單位，亦即一段具有功能性的DNA序列�；蛲ㄟ^(guò)指導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成來(lái)表達(dá)自己所攜帶的遺傳信息，從而控制生物個(gè)體的性狀表現(xiàn)。人類(lèi)約有兩萬(wàn)至兩萬(wàn)五千個(gè)基因。染色體在體細(xì)胞中是成對(duì)存在的，每條染色體上都帶有一定數(shù)量的基因。一個(gè)基因在細(xì)胞有絲分裂時(shí)有兩個(gè)對(duì)列的位點(diǎn)，稱(chēng)為等位基因，分別來(lái)自父與母輩。按照其控制的性狀，又可分為顯性基因和隱性基因。一般來(lái)說(shuō)，生物體中的每個(gè)細(xì)胞都含有相同的基因，但并不是每個(gè)細(xì)胞中的每個(gè)基因所攜帶的遺傳信息都會(huì)被表達(dá)出來(lái)。不同部位和功能的細(xì)胞，能將遺傳信息表達(dá)出來(lái)的基因也不同。
軟件截圖
