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MMPRO(分子顯示分析), is a program for displaying, analyzing, editing, converting, and animating molecular systems.
* Support for several file types (CIF, BIOSYM, XYZ, XTL, MARVIN, and GULP)
* OpenGL rendering (requires gtkglarea)
* Assorted tools for visualization (measurements, ribbons, polyhedral display)
* Useful manipulation tools, including matrix transformations and periodic image display.
* Powerful surface generation and crystal morphology tools.
* Animation of BIOSYM and GULP trajectory files
分子是物質(zhì)中能夠獨(dú)立存在的相對穩(wěn)定并保持該物質(zhì)物理化學(xué)特性的最小單元。分子由原子構(gòu)成,原子通過一定的作用力,以一定的次序和排列方式結(jié)合成分子。以水分子為例,將水不斷分離下去,直至不破壞水的特性,這時(shí)出現(xiàn)的最小單元是由兩個(gè)氫原子和一個(gè)氧原子構(gòu)成的一個(gè)水分子(H2O)。一個(gè)水分子可用電解法或其他方法再分為兩個(gè)氫原子和一個(gè)氧原子,但這時(shí)它的特性已和水完全不同了。有的分子只由一個(gè)原子構(gòu)成,稱單原子分子,如氦和氬等分子屬此類,這種單原子分子既是原子又是分子。由兩個(gè)原子構(gòu)成的分子稱雙原子分子,例如氧分子(O2)和一氧化碳分子(CO):一個(gè)氧分子由兩個(gè)氧原子構(gòu)成,為同核雙原子分子;一個(gè)一氧化碳分子由一個(gè)氧原子和一個(gè)碳原子構(gòu)成,為異核雙原子分子。由兩個(gè)以上的原子組成的分子統(tǒng)稱多原子分子。分子中的原子數(shù)可為幾個(gè)、十幾個(gè)、幾十個(gè)乃至成千上萬個(gè)。例如一個(gè)二氧化碳分子(CO2)由一個(gè)碳原子和兩個(gè)氧原子構(gòu)成。一個(gè)苯分子包含六個(gè)碳原子和六個(gè)氫原子(C6H6),一個(gè)分子包含幾百個(gè)原子,其分子式為C257H383N65O77S6。