TinkerCell(合成生物學輔助繪圖)，is a free and open-source computer-aided design (CAD) software for synthetic biology. It combines visual appeal with flexibility and functionality to meet the need of users and developers alike.r1Y紅軟基地

軟件介紹

合成生物學是生物科學在二十一世紀剛剛出現(xiàn)的一個分支學科，近年來合成生物物質(zhì)的研究進展很快。與傳統(tǒng)生物學通過解剖生命體以研究其內(nèi)在構(gòu)造的辦法不同，合成生物學的研究方向完全是相反的，它是從最基本的要素開始一步步建立零部件。與基因工程把一個物種的基因延續(xù)、改變并轉(zhuǎn)移至另一物種的作法不同，合成生物學的目的在于建立人工生物系統(tǒng)（artificial biosystem），讓它們像電路一樣運行。r1Y紅軟基地

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相關(guān)介紹

合成生物學（synthetic biology），最初由Hobom B.于1980年提出來表述基因重組技術(shù)，隨著分子系統(tǒng)生物學的發(fā)展，2000年E. Kool在美國化學年會上重新提出來，2003年國際上定義為基于系統(tǒng)生物學的遺傳工程和工程方法的人工生物系統(tǒng)研究，從基因片段、DNA分子、基因調(diào)控網(wǎng)絡與信號傳導路徑到細胞的人工設計與合成，類似于現(xiàn)代集成型建筑工程，將工程學原理與方法應用于遺傳工程與細胞工程等生物技術(shù)領(lǐng)域，合成生物學、計算生物學與化學生物學一同構(gòu)成系統(tǒng)生物技術(shù)的方法基礎。r1Y紅軟基地
合成生物學是指人們將“基因”連接成網(wǎng)絡，讓細胞來完成設計人員設想的各種任務。例如把網(wǎng)絡同簡單的細胞相結(jié)合，可提高生物傳感性，幫助檢查人員確定地雷或生物武器的位置。再如向網(wǎng)絡加入人體細胞，可以制成用于器官移植的完整器官。讓·維斯是麻省理工學院計算機工程師，早在他讀研究生時就迷上了生物學，并開始為細胞“編程”，現(xiàn)在已成為合成生物學的領(lǐng)軍人物。維斯的導師、計算機工程師和生物學家湯姆·奈特表示，他們希望研制出一組生物組件，可以十分容易地組裝成不同的“產(chǎn)品”。研制不同的基因線路———即特別設計的、相互影響的基因。波士頓大學生物醫(yī)學工程師科林斯已研制出一種“套環(huán)開關(guān)”，所選擇的細胞功能可隨意開關(guān)。加州大學生r1Y紅軟基地
 合成生物學的研究 物學和物理學教授埃羅維茨等人研究出另外一種線路：當某種特殊蛋白質(zhì)含量發(fā)生變化時，細胞能在發(fā)光狀態(tài)和非發(fā)光狀態(tài)之間轉(zhuǎn)換，起到有機振蕩器的作用，打開了利用生物分子進行計算的大門。維斯和加州理工學院化學工程師阿諾爾一起，采用“定向進化”的方法，精細調(diào)整研制線路，將基因網(wǎng)絡插入細胞內(nèi)，有選擇性地促進細胞生長。維斯目前正在研究另外一群稱為“規(guī)則系統(tǒng)”的基因，他希望細菌能估計刺激物的距離，并根據(jù)距離的改變做出反應。該項研究可用來探測地雷位置：當它們靠近地雷時細菌發(fā)綠光；遠離地雷時則發(fā)紅光。維斯另一項大膽的計劃是為成年干細胞編程，以促進某些干細胞分裂成骨細胞、肌肉細胞或軟骨細胞等，讓細胞去修補受損的心臟或生產(chǎn)出合成膝關(guān)節(jié)。盡管該工作尚處初級階段，但卻是生物學調(diào)控領(lǐng)域中重要的進展。r1Y紅軟基地
“合成生物學”更早可追蹤到波蘭科學家Waclaw Szybalski采用“合成生物學”術(shù)語，以及目睹分子生物學進展、限制性內(nèi)切酶發(fā)現(xiàn)等可能導致合成生物體的預測。“系統(tǒng)生物學”則可追蹤到貝塔朗菲的“有機生物學”及定義“有機”為“整體或系統(tǒng)”概念，以及闡述采用開放系統(tǒng)論、數(shù)學模型與計算機方法研究生物學。r1Y紅軟基地
隨著計算機、生物信息、基因合成與基因測序等技術(shù)的進展，使計算機輔助設計、全基因乃至基因組人工合成成為可能，使生物工程產(chǎn)業(yè)化的技術(shù)瓶頸可能突破，使生物產(chǎn)業(yè)能夠進入工程化與設計化的產(chǎn)業(yè)發(fā)展，導致了有如“系統(tǒng)科學與自動通訊技術(shù)”之間的理論研究與技術(shù)轉(zhuǎn)化互動，系統(tǒng)科學與生物技術(shù)、系統(tǒng)生物學與合成生物學之間的密切互動，也將導致系統(tǒng)生物技術(shù)的基礎研究向應用開發(fā)的轉(zhuǎn)化（轉(zhuǎn)化科學、轉(zhuǎn)化生物學）距離迅速縮短。r1Y紅軟基地

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